Sono disponibili due applicazioni software di Technelysium: Chromas e ChromasPro.Chromas è un visualizzatore e un editor semplice e facile da usare per il sequenziamento dei cromatogrammi. Chromas è l'ideale per i progetti di base del sequenziamento, in cui non è richiesto l'assemblaggio di più sequenze. Può esportare sequenze modificate o inviarle al server BLAST per l'identificazione. Chromas non ha capacità di allineamento.ChromasPro è per il montaggio di letture di sequenza in contigs, e anche analisi di sequenza generale come enzima di restrizione e mappatura open-reading-frame e ricerca BLAST. ChromasPro è adatto per progetti di sequencing fino a pochi megabasi, e editing e analisi di sequenze di base. È in grado di assemblare dati da sequenze di prossima generazione di 454 e Illumina, con un massimo di 100.000 sequenze se è disponibile una memoria da 2 Gb. Può anche modificare singole letture di sequenze.
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